貪污

中科園區雲林基地爆發盜挖土方並以廢紙漿汙泥回填弊案，縣內另一件重大工程、斗六市朱丹灣體育園區回填土方，2006年初，部分回填土方發出惡臭，疑使用不良土壤，縣長蘇治芬指示環保局採樣送驗，6處採樣點，有3處鋅、鎳、鉻等重金屬含量超過標準，經查出廠商使用回收再利用的廢泥漿，雖不致汙染環境，但違反土壤汙染防制法，已要求挖除。縣府為防弊端，主動將全案移送雲林調查站查辦。議員劉建國日前又接獲檢舉，指稱部分回填土方使用海砂，要求縣府處理。土地開發課證實，道路與停車場公共工程回填土方使用海砂，但海砂是工程合約許可材料，海砂價格不輸土方但海砂禁止與混凝土混合使用，避免侵蝕鋼筋。

根據中國國家審計署調查顯示，中國各地縣鄉公路改建資金使用上存在許多問題，地方為多獲取中央專項補助，重複申報、虛假申報、多報建設規模等，被挪用資金總額達人民幣10億7千萬元。 中國國務院於2002年決定實施縣鄉公路改造重大工程，計劃從2003年起用3年時間，由中央財政投入500億元，改造17萬6千公里農村公路，以解決少數鄉、村不通公路問題。但經審計後發現資金以各種方式被挪用。審計公告認為，問題主因是投資管理體制改革還不到位。由於項目數量眾多，有關部門很難了解申報項目實際情況，加上其他原因，導致投資計畫下達與項目建設脫節。另外，中央專項資金多頭下達，相互間缺乏銜接或內容交叉，為一些地方多頭申報、虛假申報提供條件。

雲林縣北港鎮萬有紙廠及金元利土方公司，涉嫌將廢紙汙泥外運，供作中科園區與高鐵基地填土，檢調懷疑有黑道或官員涉入，將中科園區原有數十萬公噸土方出售牟利，再以廢泥與一般土混合後回填。據指出，汙泥用來填土，最後會只剩5分之1的體積，將來一定會塌陷，對中科基地安全影響甚大。檢調25日出動60多人，5名檢察官帶隊分別到萬有紙廠及承包中科園區的德昌 營造、佑彰、金元利、茂勝等土方公司，帶回萬有、金元利和茂勝負責人共11人偵訊。

國際反貪污腐敗積極推動非政府組織「透明國際」（TI）在2005年3月所發表之「2005年度全球腐敗報告」報告了全球40個國家的腐敗和反腐敗形勢，暴露出國際上公共工程發生腐敗情況之嚴重性。該組織主席Mr. Elgen指出「大型公共建設中所發生的腐敗成為邁向永續發展不可逾越之障礙」，也表示「公共工程採購腐敗同使開發中及已開發國家困擾」，「當人們把賄賂金額大小看的比金錢使用價值更高，其結果導致降低工程品質與公共建設管理低劣化，腐敗會造成大量金錢浪費，使國家破產，並因建設品質不佳造成人命傷亡。」營建領域全球規模鉅大 (據估達每年3.2兆美元)，其腐敗也大大擴展了全世界腐敗之總規模，透明國際估算在工程採購方面發生的賄賂至少增加了10%之造價，全球每年因此損失高達3,200億美元，幾乎可用以解決當年之全球飢餓問題。TI將營建腐敗列為各行業之首，比軍購及油氣更甚，實應嚴肅面對。

法務部全面清查國內垃圾場近3年相關疑案，發現至少72案有貪瀆弊端，貪瀆金額高達16億餘元；甚至不乏官員、民代、黑道與業者掛鉤，決定移送檢調偵辦，不排除可能牽扯現任或卸任地方首長涉案。其中以台北縣逾10件居首。政風單位查出，這些垃圾掩埋場的工程發包、設計，有圍標、綁標情事；垃圾車的採購及維修，涉嫌浮報費用及洩漏底標；有些貪瀆的事實及浪費的情況，讓政風人員瞠目結舌。垃圾場相關弊案將陸續移送相關地檢署及調查局偵辦。